民進黨前主席謝長廷登陸產生的連鎖反應引發“獨派”反彈。據臺灣《聯合報》5日報道，前“總統府”秘書長陳師孟4日出席“臺灣如何面對中國”座談會時，針對謝長廷的“憲法各表”批評稱，這明顯抵觸民進黨黨綱，“憲法各表比一中各表更嚴重，因牽涉領土，中華人民共和國可在世界各國都稱臺灣是他們領土。民進黨不必挖空心思討好中國，應以靜制動，國家主權不能喊價”。陳師孟還稱，謝長廷以調酒大賽名義登陸，已是“跪了一半”，所謂不卑不亢，真的很“丟臉、見笑”，“在我看起來，已經差不多是奴才的情況”。前“文建會副主委”吳錦發稱，陳水扁比較正常，應該被放出來，相反謝長廷比較有問題，應該換他到榮總精神科去治療。
對此，謝長廷辦公室發言人林鶴明回應稱，尊重個人意見，但謝未違創黨初衷；反觀陳師孟在民進黨最痛苦、最難過之際退黨，已是“叛徒”；他連續兩次都做了讓綠營支持者難過的事，不應該也沒資格再將炮口向內。據了解，2011年民進黨臺南市“立委”初選爆發爭議，陳師孟因力挺的參選人未獲提名，憤而退黨。5日，民進黨主席蘇貞昌稱，討論大陸問題可以發表不同看法，但不要人身攻擊；謝長廷此次大陸行，符合他就任黨主席時提出的主張，即民進黨必須積極自信面對大陸，因此他持比較正面的看法。蘇貞昌同時強調，“黨有黨的立場”，民進黨不會放棄自己的信仰，也不會附和大陸。
據《聯合報》披露，謝長廷不排除明年再度登陸。至于時間與行程，要看這次的經驗總結和整個社會的反應，再做規劃。對此，國民黨主席馬英九表示，在野黨人士愿與大陸接近，“我們樂觀其成”，去得越多、層級越高，就代表當局過去推動的兩岸政策是正面的。美麗島電子報5日評論稱，盡管謝長廷成功開創民進黨人士訪問大陸的先例，但仍然面臨不被黨內接受的困境，“如何擺脫目前現狀，從而為民進黨與大陸互動開辟出一條新路子，無疑是當前老謝需要努力與突破之處”。文章指出他面臨的兩大困境：一是黨中央不肯背書；二是“獨派”強烈反擊。謝長廷雖然很有實力，但在民進黨內部仍然高度意識形態的氣氛中，特別是“獨派”仍然牢牢掌控黨內輿論和話語權的情況下，他要在黨內推動其主張自然相當困難。文章建議謝長廷持續推動與大陸的交流，同時說服黨內理性務實派，否則“不但對兩岸互信不利，也無法說服臺灣內部民眾接受與支持”。
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