新冠病毒基因組演化分析和譜系劃分有重要進展
新冠病毒基因組演化分析和譜系劃分有重要進展
科技日報昆明4月5日電 （記者趙漢斌）記者5日從中國科學院昆明動物研究所獲悉，該所與國內(nèi)多家研究機構(gòu)合作，解析了新型冠狀病毒基因組的演化規(guī)律，提出了具有層次結(jié)構(gòu)的譜系、亞譜系劃分系統(tǒng)。《科學通報》期刊發(fā)表了這一重要成果。
隨著感染人數(shù)增加，新冠病毒會快速發(fā)展出許多不同的株系。人類急需對這些新出現(xiàn)的變異進行梳理與描述，并更加精細化地展示新冠病毒在人群中的演變軌跡。
中科院昆明動物研究所呂雪梅、張亞平課題組與北京大學生命科學學院陸劍課題組、中國疾病預防控制中心譚文杰課題組等團隊合作，分析了121618個高質(zhì)量病毒基因組中的單核苷酸變異，篩選出201個代表性單核苷酸變異，進而逐級劃分出130個亞譜系，繪制成完整的反映各個譜系之間親緣關(guān)系的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖，同時建立了實時更新的配套網(wǎng)站以方便查看。
為闡明不同亞譜系病毒的流行程度是否有所不同，研究團隊依據(jù)譜系劃分系統(tǒng)對有具體采樣時間信息的119168個高質(zhì)量病毒基因組進行劃分，分析結(jié)果顯示，在地理條件、交通運輸、文化風俗、防疫政策、超級傳播者等各種因素共同作用下，病毒譜系在不同地域間有各自獨特的分布模式。
研究團隊還收集了國內(nèi)從2020年4月到2021年1月的輸入病例數(shù)據(jù)，將其在譜系劃分系統(tǒng)單倍型網(wǎng)絡(luò)上進行展示，可以為輸入型病例的來源提供推斷信息。
此項研究囊括了目前出現(xiàn)的絕大多數(shù)新冠基因組變異，并整理了其譜系關(guān)系，闡明各個譜系時空分布的規(guī)律，搭建出新冠病毒演化的大體框架，對理解病原體變異規(guī)律、新冠流行病學追蹤、預測病毒的演化方向有重要意義。
